Proyectos

Estructura y función de sistemas biológicos de tratamiento de efluentes.
Los sistemas de tratamiento de efluentes son biorreactores diseñados para eliminar la materia orgánica, nutrientes y micro-contaminantes del agua residual. El objetivo del esta línea de investigación es determinar los factores que influyen en la estructura de las comunidades microbianas y comprender como dicha estructura afecta la función de los procesos de tratamiento. Nuestra hipótesis es que la eficiencia y estabilidad de los sistemas biológicos de tratamiento de efluentes dependen más de la diversidad y estructura de las comunidades microbiana que de la identidad de las especies presentes. Estas tareas se llevan a cabo utilizando técnicas de secuenciación de última generación (NGS), PCR cuantitativo (real time PCR), hibridación fluorescente in situ (FISH) y geles de electroforesis en gradientes desnaturalizantes (DGGE/TGGE), en combinación con análisis multivariados que exploran la relación entre la distribución y la abundancia de los diferentes taxones bacterianos con la actividad y las variables operativas del proceso en plantas de barros activados a escala real. Estas metodologías se utilizan también para estudiar el ensamblado de comunidades bacterianas en sistemas modelo a escala de laboratorio.
Se espera proporcionar una plataforma racional que permita optimizar la eficiencia en la operación del proceso de tratamiento de efluentes, a través de la predicción de condiciones de operación óptimas y condiciones críticas que podrían producir fallas en los sistemas, y eventualmente para explorar el potencial de elaborar sistemas de tratamiento más eficientes.

Ibarbalz et al. Water Research (2013)

Diversidad y composición de microorganismos en suelos bajo régimen de siembra directa.
El objetivo general es investigar la diversidad, dinámica y ecología de las comunidades microbianas y su relación con el manejo de rotaciones y uso de fertilizantes en sistemas agrícolas.
Los objetivos específicos se enfocan en investigar los factores que determinan la estructura de la comunidad microbiana y el control de los procesos relacionados con el ciclado de nitrógeno (nitrificación y desnitrificación), a distintas escalas temporales y espaciales, en relación al manejo de suelos agrícolas.
Para este proyecto se utiliza la técnica de pirosecuenciación, seguida de un exhaustivo análisis bioinformático y validación con PCR cuantitativo.

Distributions of pairwise phylogenetic distances (A–C) and Bray–Curtis dissimilarities (D–F) between soils samples from within each land use type. (A, D) Natural environments; (B, E) good no-till agricultural practices; (C, F) poor no-till agricultural practices
Figuerola et al. Environmental Microbiology (2014)